Filøjsen er en poetisk, finurlig fortælling om et sødt blødt tumledyr, der lever ved åen under skræppebladene. En dag hopper den op på et blad og sejler ned ad åen. Der er så meget at se på, at Filøjsen må sætte farten ned.   

På rejsen møder Filøjsen blandt andet sommerfuglen Liv, der har det med at tænke lidt for meget over tingene. Men selvom Filøjsen og Liv er meget forskellige, opstår der et venskab i mellem dem – et venskab, der vil vare mange år fremover, ja måske resten af livet.   

Filøjsen følger sommerfuglens fantastiske forvandling fra puppe til fuldt udfoldet sommerfugl. På sin rejse møder den flere andre dyr, fugle og insekter, der lever i og omkring åen. De små dyr beskrives bagerst i bogen. Her får man et helt lille opslagsværk, for dem der vil vide mere om livet ved åen.   

Filøjsen er illustreret af Signe Find Larsen, der også har stået for den grafiske opsætning.