Rotter, der er pirater, bliver til PIROTTER. I PIROTTER! Under sort flag møder vi de onde og frygtindgydende pirotter, Kaptajn Rattbone og hans håndlanger Rattoo. De kidnapper den henrivende og adelige mus, Becky Nelson, og hele hendes følge.   Skildpadden Aristoteles undslipper fangenskabet og driver i land på den lille ø Eiland Rock. Her finder musen Marty Flynn ham skyllet halvdød op på stranden. Den forældreløse Marty er vokset op hos øens fyrpasser og bliver meget overrasket, da det viser sig, at Aristoteles kender hans far.