Neo-Tokyo, år 2015: Det første angreb af ´Englen´ fra rummet kunne drengen Shinji Ikari afværge i en af forskningslaboratoriet NERV's EVA-kamprobotter. Det lader dog ikke til, at faren dermed er overstået ret længe. Shinji føler sig i øvrigt ikke ret godt tilpas i sin nye rolle som helt...