Nova Franklin, en ung opfinder, tester sine magiske sæbebobler, som kan få alt, de rører ved, til at krympe. Men udenfor raser en voldsom storm, og da et vindstød pludselig blæser vinduet op, bliver Nova og hendes kat Emil bittesmå og hvirvles ud på en eventyrlig rejse: gennem byens mørke vandrør, langs brusende floder, ud i det åbne hav, helt op blandt skyerne, gennem iskolde bjergdale og videre til skjulte underjordiske søer.